港府轄下的皇家香港輔助空軍開始擴充人員編制,為籌備在90年代初,接替英國皇家空軍的職責,為英國向中國移交香港主權做好準備。
1988
皇家香港輔助空軍在1993年3月31日解散,翌日政府飛行服務隊於1993年4月1日正式成立,全體人員、16架飛機、及其位於啓德機場場的設施全部過渡到的新成立的部隊。
1993
1997年2月20日,政府飛行服務隊定翼飛機Beech Super King Air (B-HZM)成為首架降落赤鱲角機場的飛機。
1997
政府飛行服務隊總部遷往位於赤鱲角的香港國際機場。
1998
2000年8月,政府飛行服務隊與香港急症醫學學院合辦「空中醫療計劃」,培訓醫務人員成為空中醫療主任(飛行醫生)及空中醫療護士(飛行護士)為傷者在現場和在送院途中,提供緊急治療。
2000
引進兩架龐巴迪挑戰者605成為現役定翼機隊。
2016
引進七架空中巴士175直升機成為現役主力救援直升機。
2018
啟德分部落成,將為市民提供更快捷的緊急服務。
2022
飛行模擬訓練中心(FSTC)投入使用,為飛行員提供更全面的模擬訓練,以提升其在執行任務時的應變能力。
2023